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医学・生命科学の学際領域での研究の現状を理解する
This course provides lectures on advanced medicine and life science research in order to understand interdisciplinary research.
医学・生命科学の学際領域での研究の現状を理解する
This course provides lectures on advanced medicine and life science research in order to understand interdisciplinary research.
研究を推進する上で求められる姿勢・技術の涵養
To learn research ideas, procedures, and ethics
研究を推進する上で求められる姿勢・技術の涵養
To learn research ideas, procedures, and ethics
国際的なすぐれた業績を持つ研究者の最新の話題についてのセミナーに参加し、知識の
涵養と研究推進に求められる思考法を学ぶ。英語力の増進にも役立つと期待される。
To learn the scientific thinking and idea of internationally active researchers
by attending their lectures.
国際的なすぐれた業績を持つ研究者の最新の話題についてのセミナーに参加し、知識の
涵養と研究推進に求められる思考法を学ぶ。英語力の増進にも役立つと期待される。
To learn the scientific thinking and idea of internationally active researchers
by attending their lectures.
国際的なすぐれた業績を持つ研究者の最新の話題についてのセミナーに参加し、知識の
涵養と研究推進に求められる思考法を学ぶ。英語力の増進にも役立つと期待される。
To learn the scientific thinking and idea of internationally active researchers
by attending their lectures.
各自が着手している医学AIに関する研究課題について、定期的に内容を発表し、他者の批評を受ける。これらの活動を通じて、手法の立案、科学的正当性の担保、研究の制約、計画の実現性、成果の価値について学ぶ。
Regularly present the research topics related to medical AI that each individual is working on, and receive feedback from others. Through these activities, learn about method planning, scientific validity ensuring, constraints in research, feasibility of plans, and the value of outcomes.
本実習では東北メディカル・メガバンク機構(ToMMo)のスーパーコンピュータを用いてビッグデータ解析の手法を学習する。
近年の技術革新によってゲノムをはじめとする医学研究に用いられるデータはますます大規模となりつつあり、そのようなビッグデータの解析には専用のスーパーコンピュータが必要となってきている。ToMMoのスパコンはこのような個人レベルのビッグデータを安全に解析することのできる計算機環境である。参加者はスパコンへのアカウント作成、アクセス、データアップロード、データ解析、データダウンロードを行う。本実習ではToMMoのコホートデータは扱わないが、個人レベルの情報への注意点について学習する。データ解析についてはジョブスケジューリングシステムであるSLURMを用いた大規模実行を行う。この実習により、医学データやToMMoのコホートデータの解析の基礎を学ぶ。更に、応用例としては、医療データセットを用いて実際の臨床現場で使用されている課題の解決を図る。
This course aims to learn big data analysis by using the supercomputer system of the Tohoku Medical Megabank Organization (ToMMo).
Due to recent advancement of technologies, the size of data used in medical researches, e.g. genome data, has been increasing in size, and it is necessary to use specialized supercomputers to analyze such big data. The supercomputer system of ToMMo is suitable for analyzing individual-level big data in a secure environment. Students will learn to create an account of the supercomputer, access to it, upload data to it, analyze data with it and download data from it. Though the cohort data of ToMMo will not be used in this course, students will learn secure treatment of individual-level data in the supercomputer. To run a large-scale data analysis, job-scheduling system, SLURM, will be used. Students will learn the basics of large-scale medical data analysis through this course. Students can also use the supercomputer for addressing the problems in clinics by using their own medical data sets.