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進化学実習 / Laboratory of Evolutionary Biology 

前期 月曜日 4講時 / 前期 火曜日 4講時 / 前期 水曜日 4講時 / 前期 木曜日 4講時. 単位数/Credit(s): 2. 担当教員/Instructor : 牧野 能士, 酒井 聡樹, 牧 雅之. 学期/Semester: 前期. 開講年度/Year: 2024. 科目ナンバリング/Course code/number: SBI-BIO377J. 使用言語/Language Used in Course: 日本語.

主要授業科目/Essential Subjects

所属講座等

進化ゲノミクス分野
植物進化多様性分野
植物繁殖生態分野 

授業題目

進化学実習 

Course Title

Laboratory of Evolutionary Biology 

授業の目的と概要

Rをつかったデータ分析の基本
形態による系統解析
植物の開花戦略の解析

Purpose/Abstract

Basic data analyses by R
plant ecology analysis
morphological analyais
estimation of phylogeny by morphology
sex determination by molecular marker
analyses for flowering strategies for plants 

学習の到達目標

Rを使ったデータ解析、形態解析、野外データ解析の基礎を習得 

Goal

Understanding basic techniques of analyzing data for evolution 

授業内容・方法と進度予定

進化ゲノミクス Rの基礎的な使用方法
進化ゲノミクス Rを使ったデータ処理1
進化ゲノミクス Rを使ったデータ処理2
進化ゲノミクス Rを使ったデータの可視化
進化ゲノミクス Rを使ったデータ分析
植物進化多様性 被子植物の花の多様性 スケッチ(要ケント紙)
植物進化多様性 特殊環境へ適応した植物の形態観察・形態の定量化1(要ケント紙)
植物進化多様性 特殊環境へ適応した植物の形態観察・形態の定量化2(要ケント紙)
植物進化多様性 特殊環境へ適応した植物の形態観察・形態の定量化3(要ケント紙)
植物進化多様性 Rを使ったデータ解析1
植物進化多様性 Rを使ったデータ解析2
植物繁殖生態 訪花者の行動のビデオ解析
植物繁殖生態 虫媒花の開花戦略および訪花者の訪花行動の理論的解析
植物繁殖生態 Rを使ったデータ解析1
植物繁殖生態 Rを使ったデータ解析2 

Contentsandprogressscheduleofthe class

Installation and basics of R
Data processing by R
Graphical analysis by R
Data analysis by R
Observation of External Morphology of Plant Diversity Plants: Sketches and Phylogenetic Analysis of Some Species of the Genus Prunus (Kent paper) and Calculations (PC is convenient)
Data Analysis Using Plant Diversity Data Analysis R
Molecular Ecological Analysis of Plant Diversity: Sex Discrimination DNA Extraction, PCR and Electrophoresis of Aoki by Molecular Markers
Molecular Ecological Analysis of Plant Diversity: Sex Discrimination DNA Extraction, PCR and Electrophoresis of Aoki by Molecular Markers
Observation of pollinator behavior on recorded videos
Model analysis of optimal flowering strategies and pollinator behavior
Data analysis by R 

成績評価方法

出席とレポート 

Grading

Attendance and reports 

教科書および参考書

配付 

Books required/referenced

Suggestion in the class 

授業時間外学習

適宜指導 

Preparation and review

Depending on the students 

実務・実践的授業/Practicalbusiness※○は、実務・実践的授業であることを示す。/Note:"○"Indicatesthe practicalbusiness

〇 

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